沈梦圆的博客 怕什么真理无穷, 进一寸有一寸的欢喜。

【教程】jupyter notebook上的宏基因组分析教程


通过一个博客然后点点点,发现好多有用的东西,简直就好像发现新大陆,才知道大家原来都是这样分析、做研究的。虽然对我的工作没特别大的帮助,也不算不务正业吧。多看看,多学学总是没错的。

在linux上安装jupyter notebook

几周前我安装了anaconda,该软件安装的时候已经按照了jupter notebook了。单独安装也很方便,参照官方文档:https://jupyter.readthedocs.io/en/latest/install.html 1

有趣的Ipython notebook

  • 下面是github上收集的一些有趣的ipython notnook,看了几个生信相关的教程,我觉得挺好玩的。 https://github.com/ipython/ipython/wiki/A-gallery-of-interesting-IPython-Notebooks

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宏基因组分析教程

3 http://nbviewer.jupyter.org/github/germs-lab/frontiers-review-2015/blob/master/frontiers-nb-2015.ipynb 似乎用python的越来越多,教程也都是python的多。这让我学perl的人咋办~~ 大家从上面的链接把ipynb下载下来,接下来放到自己服务器的工作目录下,启动ipython notebook,打开即可。 4 5 6


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