很开心在我的积极询问下,我的小老板终于给我确定了研究方向。一句话:利用宏基因组技术去探索蓝藻水华的微囊藻群体随季节变化的规律;关键词:蓝藻水华、微囊藻群体(藻菌关系)、比较宏基因组。我呢,大概是属于环境生态方向,我在过去的一年里,绝大数时间都是在自学生物信息方向,总体来说还是初级入门小菜鸟,但我相信自己的能力,在未来即将正式开始科研生涯里会做好相关的数据分析工作。
项目的可行性
- 研究材料和数据是实验室特有的,并且有研究基础,方法学和构建了初级的微囊藻和群体中细菌的基因组库,为后续的项目做了坚实的铺垫。
- 虽然在蓝藻水华中藻菌关系的季节动态变化,已经有人研究过了。但是我们换了一个方法和角度研究,是一个切实可行的科学研究项目。
- 最后,在项目中可能要用到太湖的气象、水文、水质数据,由于采样过程中未记录这些,所以这方面的数据需要看文献来收集,需要保证数据的可靠性。
查阅文献
在这之前,我断断续续地查阅过文献,大多数是通过香港谷歌得到的,同时下载得到的PDF文件也未得到及时的归类整理。到目前为止,大概有70来篇。在项目开始之前,都要进行文献检索。一是学习知识,二是了解所研究方向的历史和研究成果如何了,以便更好的开展项目研究。 下面是我昨天看一个博客将如何查阅文献的帖子,http://www.andrewsun.net/panta_rhei/archives/5982?from=timeline&isappinstalled=0 我做了一些笔记,字比较难看,但意思大概都能看得懂,哈哈。并且今天一整天收集了一百来篇文献,Endnote还没用熟练,但比起先前来说文献有条理多了。 总是,通过看文献就是解决以下的问题:
- 本领域最初是要解决哪些基本问题?
- 后来随着认识的深入,原来的问题又转化成了什么新问题?
- 目前大家主要想解决什么问题?
- 对于各个问题,理论方面提出过哪些模型?实验上主要有哪些方法?