跟健明师兄认识是通过他的博客—生信菜鸟团,被他无私分享的精神而感染。在后面的接触过程中得知是自己的校友,不免就多了几分亲切感。下面是 昨天已经进阶成生信大神的师兄在群里分享了他和生信之间的几个小故事,满满的正能量。我读完以后非常感动,同时也备受鼓舞,得到师兄的许可 ,在这里也分享给大家。
这是一篇发表在Nature Microbiology的评论性文章,微生物群体研究方向我也有思考过,在对于分离纯培养这方面曾询问过导师的意见,因实验存在难度、费时费力而被委婉拒绝了。但我相信这一步应该是未来微生物组研究必须突破的难关。以下是几位专家的观点,让我们来看看:
最近学习了一下基因组的拼接原理,以下是我的学习笔记和一些思考。基因组的拼接原理是高通量测序技术的基础知识吧,我个人认为即使不做基 因组拼接工作,也可以学习一下几个主流拼接软件的算法和原理。我主要是学习了两个网上教程,其教程出处为https://github.com/ TGAC/361Division/tree/master/de_novo_2016和https://github.com/ lexnederbragt/INF-BIO9120_fall2013_de_novo_assembly/tree/master/presentations。
很开心在我的积极询问下,我的小老板终于给我确定了研究方向。一句话:利用宏基因组技术去探索蓝藻水华的微囊藻群体随季节变化的规律;关键词:蓝藻水华、微囊藻群体(藻菌关系)、比较宏基因组。我呢,大概是属于环境生态方向,我在过去的一年里,绝大数时间都是在自学生物信息方向,总体来说还是初级入门小菜鸟,但我相信自己的能力,在未来即将正式开始科研生涯里会做好相关的数据分析工作。
全外显子测序是啥?转录组测序是啥?转录组测序又是啥?他们之间有什么差别么?傻傻分不清,不用怕,多学习下就会了,下面让我们一起来看看!
蓝藻水华是湖泊富营养化的一个主要灾害结果,水华的爆发及其释放的有害产物对水体生态系统、人和畜禽等造 成严重危害。蓝藻水华在世界范围内的受关注程度持续未减,尤其是在2007年由于太湖蓝藻水华爆发导致的无锡 市“5.29供水危机”事件以后,中国有关蓝藻水华研究暨SCI论文数目已经持续在世界处于领先地位。大量的研究 已经从水文气象、营养盐、食物链和蓝藻基因组等角度来探索蓝藻水华爆发机制,但至今仍为完全解明。微生物 在水体循环、能量转化和信息传递等方面均发挥着重要作用。大量研究已经表明,微生物积极参与了蓝藻水华暴 发的各个过程,所以从微生物角度来探索蓝藻水华的暴发机制具有重要的意义。因此此次会议围绕探讨蓝藻水华 与微生物互作的机制,期望通过同行交换意见和深入探讨、推动该领域的发展。
会议所涉及的主要议题如下:
蓝藻水华的多样性以及多态表型;
蓝藻水华与附生细菌的互作机制;
蓝藻水华与浮游细菌的互作机制;
蓝藻水华种类的演替规律及其机制;
蓝藻水华的生物驱动因子和形成机理;
蓝藻水华中的藻菌关系对水华治理的启示;
其它蓝藻水华研究的新方法。