两位计算生物学专家2013年发表在nature biotechnology上给即将开始科研项目的你的实用建议。 计算生物学家包含几个不同的角色,数据分析者,数据收集者1,数据库开发者,统计学家,数学建模者,生物 信息学家,软件开发者,存在论者等。计算机是现代生物学研究所必需的工具,科学家们要求掌握新的计算生物 技能和新的专业术语(Box 1)。无论你是学生、教授还是介于两者之间,如果你发现计算分析对于你的研究越来 越很重要,以下的建议会对你成为一名计算生物学家挺重要的。现我将十条建议翻译如下,如你感兴趣可看原文http://www.cbcb.umd.edu/~sridhar/Docs/Loman-CompBiol.pdf。
统计clean.fa文件的碱基个数和GC%,在此之前我利用别人的代码看了一下clean.fa文件基本信息如下:
上个月看了一篇2016年RNA-Seq文献综述,那篇文献特别长,花了三四天时间才看完。当时为了做组会文献报告做了一些许总结,以ppt的形式呈现出来。
紧接着上个星期学习初步认识了宏基因组学的基本概念、了解的宏基因组数据分析方面的软件。我继续深入学习,这里是学习TGAC宏基因组教程的学习笔记。TGAC Metagenomics 2015教程
上图是我第一次看见二师兄用R做出来的图,当时的感觉就好漂亮,当时在场的李老师给解释了半天,说每个Group是个颜色等等。其实我当时是挺好奇的是这个图到底是怎么画出来的呢。(当时的我刚进实验室,大概只会用Excel绘制一些柱状图和饼图这些简单的统计图形。)
再过一个星期,本学年的最后一门课程就会结束了。 那么我的博一也就到了尾声,步入二年级。 一年又一年,我们总要向更好发展,逆水行舟不进则退,学习如此,生活也是如此。